機械学習によるin silicoスクリーニング技術CGBVSを用いて、学習可能なリガンドデータが無いようなオーファンターゲット(GPCR)に対するリガンド予測の性能評価を行った論文が掲載されました。
化合物とタンパク質のそれぞれの記述子(特徴量)について、複数の組み合わせを検討しており、オーファンターゲットのリガンド予測にはMSA(Multiple Sequence Alignment)を利用したタンパク質記述子が有効であることが示されました。
また我々は、オーファンターゲットに対するCGBVS法の適用可能性を測るApplicability Indexを定義し、Applicability Indexがある閾値以上の値になるターゲットに対しては高い予測精度が期待できることを示しました。
https://doi.org/10.3390/molecules26175131
Category: Announcement, CGBVS/CzeekS