分子の母核構造の重ね合わせ 中編 Posted on 2021年12月17日2022年2月22日 by 株式会社インテージヘルスケア 金井 千里 前編から引き続いて分子の回転についてです。今回は分子を重ね合わせるための数式を導出したいと思います。 目的関数 四元数のイントロが終わってようやく本題に入ります。分子の3次元的な重ね合わせですが、動かす分子の座標ベクトル… Category: OpenBabel, プログラミング関連 Read more
分子の母核構造の重ね合わせ 前編 Posted on 2021年12月12日2022年2月22日 by 株式会社インテージヘルスケア 金井 千里 今回の話題は分子の回転についてプログラミングしてみます。話が長くなりそうなので、ブログを幾つかに分割して紹介します。 はじめに 前回は母核構造を固定してコンホメーションサーチをしてみました。色々なコンホメーションを発生さ… Category: OpenBabel, プログラミング関連 Read more
母核構造を固定してコンホメーションサーチ Posted on 2021年11月14日2022年2月22日 by 株式会社インテージヘルスケア 金井 千里 今回のブログもOpenBabelの分子力場の話題です。母核構造など、化合物分子の一部を固定してのコンホメーションサーチをやってみようと思います。 はじめに 前のブログではOpenBabelの分子力場のAPIを利用して低分… Category: OpenBabel, プログラミング関連 Read more
最新のUSB充電器を買った話 Posted on 2021年9月13日2022年2月22日 by 株式会社インテージヘルスケア 金井 千里 最近のスマートフォンやタブレットは充電口がUSB type-Cになっていて、急速充電に対応するものも多いです。また、ノートPCもUSB type-Cから給電できるものが増えてきて、私が会社から支給されているPCもUSB給… Category: 雑記 Read more
OpenBabelでコンホメーションサーチ Posted on 2021年9月2日2022年2月22日 by 株式会社インテージヘルスケア 金井 千里 前回に引き続き分子力場の話題の第二弾です。今回は最安定構造を探索してみようと思います。 Category: Linux関連, OpenBabel, プログラミング関連 Read more