PDBファイルの残基番号を修正する 前編 Posted on 2022年10月23日2023年1月5日 by 株式会社インテージヘルスケア 金井 千里 はじめに RCSB Protein Data Bank (RCSB PDB) には非常に多くのタンパク質の構造が登録されていますが、稀に残基番号がずれている場合があります。そのようなPDBファイルの場合、これに紐付いてい… Category: OpenBabel, プログラミング関連 Read more
エクセル形式の化合物リストを作成する Posted on 2022年8月28日2022年8月30日 by 株式会社インテージヘルスケア 金井 千里 はじめに このブログを始めた頃はPythonはあまり得意ではなく、専らC++でプログラムを書いてました。しかしながら、Pythonを使用せざるを得ないことが多く、私も大分Pythonに慣れてきました。私の最初のブログを見… Category: RDKit, プログラミング関連 Read more
新しいPCをセットアップした話 Posted on 2022年7月26日2022年7月29日 by 株式会社インテージヘルスケア 金井 千里 最近自分が使用しているPCを新調しました。今回はまっさらなPCに自分流のプログラミングに適した環境にセットアップしたときの記録です。 Category: プログラミング関連, 雑記 Read more
C++の線型代数ライブラリEigenの使い方備忘録 〜応用編〜 Posted on 2022年6月8日2022年6月8日 by 株式会社インテージヘルスケア 金井 千里 前回のブログではEigenを利用したベクトルと行列の基本的な使い方についてまとめました。今回は線型方程式や固有値問題の解を求めるEigenの利用方法についてまとめます。この応用編についても自分用の備忘録としてまとめたもの… Category: プログラミング関連 Read more
C++の線型代数ライブラリEigenの使い方備忘録 〜基本編〜 Posted on 2022年5月8日2022年6月8日 by 株式会社インテージヘルスケア 金井 千里 近年C++でよく利用されている線型代数ライブラリであるEigenの使い方について簡単にまとめました。私もたまに利用するのですが、使用頻度が低いため使い方を忘れてしまいます。忘れる度にネット検索して調べるのですが、いいかげ… Category: プログラミング関連 Read more