ドッキングプログラムsminaのビルド Posted on 2023年3月7日2023年3月7日 by 株式会社インテージヘルスケア 金井 千里 はじめに 最近CMakeに関する話題についてブログ投稿していて、OpenBabelやRDKitを利用したプログラムをビルドするためのCMakeの利用方法について紹介してきました。今回は実践編ということで、私が良く利用する… Category: Docking, Linux関連, プログラミング関連 Read more
RDKitを利用するC++プログラムのCMakeによるビルド Posted on 2023年1月6日2023年1月6日 by 株式会社インテージヘルスケア 金井 千里 はじめに 今回の話題はRDKitを利用したC++プログラムについてCMakeを適用しようと思います。今までCMakeについて2回ブログを書きましたが、実はこの話をブログにしたいからでした。RDKitというライブラリはOp… Category: Linux関連, RDKit, プログラミング関連 Read more
OpenBabelを利用するC++プログラムのCMakeによるビルド Posted on 2022年12月26日2023年1月5日 by 株式会社インテージヘルスケア 金井 千里 はじめに 前回はCMakeの簡単な使い方を紹介しました。今回はOpenBabelを利用したC++プログラムのビルド（コンパイル）について紹介します。一旦CMakeLists.txtファイル作成してしまえば、その後のプログ… Category: Linux関連, OpenBabel, プログラミング関連 Read more
CMakeを利用したC++プログラムのコンパイル Posted on 2022年12月19日2023年1月5日 by 株式会社インテージヘルスケア 金井 千里 はじめに 実際のC++のプログラムはソースコードのファイルが単一である場合はほとんど無いです。少なくともプログラム本体とヘッダーファイルは分離して扱います。また、OpenBabelやRDKit等のライブラリも複数リンクす… Category: Linux関連, プログラミング関連 Read more
PDBファイルの残基番号を修正する 後編 Posted on 2022年10月30日2023年1月5日 by 株式会社インテージヘルスケア 金井 千里 はじめに 前編ではFASTAファイルを読み込む部分のプログラムを作成しました。後編ではOpenBabelを利用してPDBファイルの残基番号の修正をします。プログラムに入力するデータなどは前編で紹介したものを利用する仕様に… Category: OpenBabel, プログラミング関連 Read more