CGBVSによる化合物スクリーニングソフトウェア「CzeekS」のマシンラーニングベース予測モデルが更新されました。主な更新内容は以下となります。 ChEMBLデータのリリース30を使用しました Kinaseモデル対象タ…
Category: CGBVS/CzeekSカテゴリー: CGBVS/CzeekS
ChEMBL29のデータを利用したCGBVSの予測精度の検証
今回は弊社のソフトウェア製品であるCzeekSを使って、CGBVS法の予測精度の検証を行いました。現在弊社で作成済みのCGBVSモデルはChEMBL27のデータを基にしております。ChEMBLdbの最新バージョンは29な…
Category: CGBVS/CzeekS, Machine LearningApplication of different machine learning approaches to ligand prediction of orphan GPCR targets
As I have mentioned in my previous blog, in this blog I will be talking about LightGBM. However, this is not e…
Category: CGBVS/CzeekS, DRAGON/alvaDesc, Machine Learningオーファンターゲットに対する予測計算：Applicability Indexを計算してみました
2021年8月に発表させていただいたCGBVS法の論文では、応用として学習データのないターゲットの予測可能性について検証しています。この論文ではデータのない標的タンパクに対する化合物スクリーニングの予測精度（AUROC）…
Category: CGBVS/CzeekS, DRAGON/alvaDesc, Machine Learning【論文掲載】Computational Prediction of Compound–Protein Interactions for Orphan Targets Using CGBVS
機械学習によるin silicoスクリーニング技術CGBVSを用いて、学習可能なリガンドデータが無いようなオーファンターゲット（GPCR）に対するリガンド予測の性能評価を行った論文が掲載されました。 化合物とタンパク質の…
Category: Announcement, CGBVS/CzeekS