OpenBabelでコンホメーションサーチ Posted on 2021年9月2日2022年2月22日 by 株式会社インテージヘルスケア 金井 千里 前回に引き続き分子力場の話題の第二弾です。今回は最安定構造を探索してみようと思います。 Category: Linux関連, OpenBabel, プログラミング関連 Read more
OpenBabelで分子構造のエネルギー極小化 Posted on 2021年8月29日2022年2月22日 by 株式会社インテージヘルスケア 金井 千里 論文書いていたため、なかなかブログの更新していなかったのですが、久々にOpenBabelプログラミングネタのブログを投稿していこうと思います。今回はOpenBabelの分子力場を利用した計算をテーマにしたいと思います。 Category: Linux関連, OpenBabel, プログラミング関連 Read more
OpenBabelやRDKitのAPIドキュメント Posted on 2021年4月13日2022年2月22日 by 株式会社インテージヘルスケア 金井 千里 今回はOpenBabelやRDKitなどのフリーツールを利用してプログラミングする際に必須であるAPIドキュメントについてです。 Category: Linux関連, OpenBabel, RDKit, プログラミング関連 Read more
RDKitでもC++プログラミング ~類似構造検索~ Posted on 2021年4月1日2022年2月22日 by 株式会社インテージヘルスケア 金井 千里 今回の話題は前回から引き続き類似構造検索(Similarity Search)についてです。タイトル通り、RDKitでC++プログラミングするという内容です。RDKitを取り上げるのは初めてで、ブログって何を書くか毎回… Category: Linux関連, RDKit, プログラミング関連 Read more
OpenBabelでC++プログラミング ~類似構造検索~ 後編 Posted on 2021年3月22日2022年2月22日 by 株式会社インテージヘルスケア 金井 千里 今回は前編に引き続きOpenBabelを利用した類似構造検索(Similarity Search)についてです。後編ではプログラムを解説します。 Category: Linux関連, OpenBabel, プログラミング関連 Read more