今回は弊社のソフトウェア製品であるCzeekSを使って、CGBVS法の予測精度の検証を行いました。現在弊社で作成済みのCGBVSモデルはChEMBL27のデータを基にしております。ChEMBLdbの最新バージョンは29な…
Category: CGBVS/CzeekS, Machine Learningカテゴリー: Machine Learning
Application of different machine learning approaches to ligand prediction of orphan GPCR targets
As I have mentioned in my previous blog, in this blog I will be talking about LightGBM. However, this is not e…
Category: CGBVS/CzeekS, DRAGON/alvaDesc, Machine LearningUsing ChEMBL Structure Pipeline to standardize compound structure data
As I have promised in my previous blog regarding curation of chemogenomics data, this time I will be talking a…
Category: Machine Learning, RDKitオーファンターゲットに対する予測計算：Applicability Indexを計算してみました
2021年8月に発表させていただいたCGBVS法の論文では、応用として学習データのないターゲットの予測可能性について検証しています。この論文ではデータのない標的タンパクに対する化合物スクリーニングの予測精度（AUROC）…
Category: CGBVS/CzeekS, DRAGON/alvaDesc, Machine LearningSimple tips when performing curation of chemogenomics data
If you are someone who is intending to create predictive models to determine, for example, the probability of …
Category: Machine Learning