前回に引き続き部分構造検索ネタでいきます。今回はもう少し実用的なプログラムを紹介します。それは医薬品として望ましくない部分構造を持つ化合物をライブラリから排除するプログラムです。日本において購入できる低分子化合物は10…
Category: OpenBabel, プログラミング関連OpenBabelでC++プログラミング ～部分構造検索 その1～
【論文掲載】Strategies for Design of Molecular Structures with a Desired Pharmacophore Using Deep Reinforcement Learning
Our research, entitled as above, has been published recently in Chemical and Pharmaceutical Bulletin. It is re…
Category: Announcement, Deep QuartetKNIMEを用いてのCGBVS計算を行います（後編）
このブログの前編は次のリンクで拝見できます：KNIMEを用いてのCGBVS計算を行います（前編）。 今回は、KNIME上でCGBVSワークフローとその実行の話をさせていただきます。作業ステップは以下のように分けています。…
Category: CGBVS/CzeekS, DRAGON/alvaDesc論文紹介（SIRT1活性化合物の探索）
学生アルバイトKさんのLigandScout関連論文の紹介記事です．LigandScoutの活用事例としてご参考になれば幸いです． （以下，論文紹介記事） 本記事では、次の論文を、LigandScoutの利用を中心に紹…
Category: LigandScout