ブログ開始 こんにちは、私はインテージヘルスケアの金井といいます。in silico創薬における受託解析計算などを仕事にしています。今回、私もブログなるものを書くことになりました。何分初めてのことで、in silico…
Category: プログラミング関連Ligand Expoに対するファーマコフォア探索
今回は、PARP-1のファーマコフォアを使って、Ligand Expoに登録されている化合物データに対して探索を行ってみます。 Step 1: Ligand Expoから化合物データの取得 ここから以下の２つのファイルを…
Category: LigandScoutLigandScoutでバーチャルスクリーニング
今回は、LigandScoutを用いたファーマコフォアの構築とバーチャルスクリーニングを行ってみます。 例として、DUD-EからPARP1の阻害剤とそのデコイを取得してバーチャルスクリーニングを実施します。DUD-Eは、…
Category: LigandScout